Parfois, il s'agit de tatouages intra-muqueux de repérage réalisés au cours d’une intervention chirurgicale pour l'exérèse d'une tumeur dont la nature bénigne ou maligne n'est pas connue à priori. Le repérage, le plus souvent au bleu de méthylène, facilite une éventuelle ré-intervention pour complément d'exérèse après étude histologique de la pièce et des recoupes, ou le centrage en vue d'une irradiation externe.
Il arrive que le colorant utilisé diffuse largement dans la muqueuse.