Le diagnostic d'érythroplasie étant confirmé par une biopsie, le traitement et le pronostic dépendent des caractéristiques histologiques. Celles-ci, presque toujours sévères, amènent certains auteurs à ne plus considérer l’érythroplasie comme une lésion précancéreuse dans le sens accepté du terme (il s'agit d’un vrai cancer).
Le plus souvent, l'élimination de la lésion est indiquée. Le traitement devra alors être adapté à l'extension des lésions et aux contreindications éventuelles liées à l'âge des malades.